69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3959 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 94 aa  194  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  95.59 
 
 		 124 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  95.59 
 
 		 124 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  95.59 
 
 		 124 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  95.59 
 
 		 133 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  95.59 
 
 		 121 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  94.12 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  94.12 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  94.12 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  94.12 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  94.12 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  89.04 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  83.82 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  82.35 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  82.35 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  79.41 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  79.41 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  79.41 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  66.18 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  66.18 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  66.18 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  66.18 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  84.91 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  63.24 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 99 aa  97.1  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  67.24 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  67.24 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  67.24 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  67.24 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4724  transposase IS3/IS911  63.08 
 
 		 71 aa  93.6  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240633  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  86.54 
 
 		 53 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5091  hypothetical protein  72.34 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.774813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  42 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  42 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  42 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  42 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  42 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  28.99 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  42.22 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  39.13 
 
 		 154 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0065  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1618  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  37.74 
 
 		 96 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  37.74 
 
 		 96 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>