19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3877 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3877  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  345  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.65728  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  41.45 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1246  hypothetical protein  40 
 
 		 201 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.96129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3870  hypothetical protein  40.82 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  40.88 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2074  hypothetical protein  32.56 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2260  hypothetical protein  42.39 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  32.48 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5261  putative nutrient deprivation-induced protein  27.13 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  26.81 
 
 		 274 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1322  hypothetical protein  29.5 
 
 		 277 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  26.81 
 
 		 274 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4233  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5620  nutrient deprivation-induced protein  28.4 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.188949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  27.22 
 
 		 321 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4348  hypothetical protein  28.91 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.915436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3901  putative nutrient deprivation-induced protein  32.35 
 
 		 190 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0076342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7552  hypothetical protein  27.74 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0606564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>