12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3876 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3876  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1436  hypothetical protein  28.43 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.050652  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  26.88 
 
 		 407 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  43.57 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1245  late embryogenesis abundant protein  36.81 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  32.56 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  29.81 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2258  hypothetical protein  27.33 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  23.75 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  24.4 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  24 
 
 		 329 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>