80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3446 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3446  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  100 
 
 		 342 aa  705    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0777  nitrate reductase, delta subunit  88.01 
 
 		 342 aa  634    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0205  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  34.86 
 
 		 181 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2654  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  35.35 
 
 		 177 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0331  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  33.1 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000424916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2805  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  35.35 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0248  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  33.96 
 
 		 177 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1529  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.68 
 
 		 183 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139315  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0507  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  32.74 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.993559  normal  0.350647 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1237  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  33.33 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.837761  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3701  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  38.1 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1405  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  26.15 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1826  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  42.03 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.909351  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2893  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.6 
 
 		 236 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1706  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  35.29 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.887817  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0273  respiratory nitrate reductase, delta subunit  29.63 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3084  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.06 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.767842  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0297  respiratory nitrate reductase, delta subunit  29.63 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2172  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  35.29 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4427  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.12 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2234  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  32.03 
 
 		 226 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1777  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  35.29 
 
 		 182 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3401  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.03 
 
 		 181 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1332  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  31.67 
 
 		 259 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03845  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  24.48 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2137  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.69 
 
 		 177 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0179  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.99 
 
 		 223 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5443  respiratory nitrate reductase, delta subunit  31.2 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247516  normal  0.223039 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2127  nitrate reductase delta chain  34.18 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0194  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  27.94 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107326  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2277  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  34.18 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2160  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  34.18 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1934  nitrate reductase, delta subunit  34.18 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.395358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1956  nitrate reductase, delta subunit  34.18 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0503251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1979  nitrate reductase delta chain  34.18 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2038  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.47 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4476  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.15 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2637  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  39.19 
 
 		 191 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5004  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  32.99 
 
 		 225 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1910  hypothetical protein  38.1 
 
 		 96 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3178  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.23 
 
 		 176 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1956  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  26.77 
 
 		 244 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.389799 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1001  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  27.87 
 
 		 231 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.873205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0976  putative respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  30.08 
 
 		 226 aa  49.3  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1973  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  32.5 
 
 		 176 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1922  nitrate reductase delta subunit protein  34.09 
 
 		 192 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2518  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  25.95 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.707625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2632  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  26.72 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.227411  normal  0.019972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2158  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  38.71 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0149092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1348  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  34.67 
 
 		 236 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1761  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.95 
 
 		 226 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441918  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5211  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.17 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1852  nitrate reductase, delta subunit  28.78 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18700  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  34.78 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0833774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3140  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.21 
 
 		 207 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121684  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1778  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  28.74 
 
 		 332 aa  46.2  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1909  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.21 
 
 		 179 aa  46.2  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2683  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  26.53 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1733  nitrate reductase, delta subunit  26.53 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3673  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.96 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3075  nitrate reductase, delta subunit  26.53 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2243  nitrate reductase, delta subunit  26.53 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0183466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1207  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  37.14 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.17695  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4234  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.37 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0808187  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1516  nitrate reductase, delta subunit  26.53 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3597  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.16 
 
 		 184 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865083 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3594  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.82 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.202827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0902  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  35.94 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2881  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.46 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1489  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  32.14 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4671  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.82 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2627  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  26.28 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.396809  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4544  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.36 
 
 		 226 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2975  hypothetical protein  34.25 
 
 		 104 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5682  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  27.82 
 
 		 248 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2759  nitrate reductase, delta subunit  26.98 
 
 		 238 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.639907  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0567  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  36.51 
 
 		 175 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11188  respiratory nitrate reductase delta subunit narJ  28.35 
 
 		 201 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1389  hypothetical protein  30 
 
 		 89 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205625  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0668  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  25.2 
 
 		 287 aa  42.7  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>