46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1424 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1424  phage protein  100 
 
 		 298 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1179  hypothetical protein  84.85 
 
 		 297 aa  507  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1991  bacteriophage protein  72.92 
 
 		 307 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0367109  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1822  bacteriophage protein  72.18 
 
 		 296 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0287407  normal  0.370598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2115  hypothetical protein  69.31 
 
 		 303 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0742947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3460  bacteriophage protein  72.54 
 
 		 306 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3169  phage protein  53.85 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199001  normal  0.0261445 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1416  hypothetical protein  52.58 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.0498255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4294  hypothetical protein  50.17 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0795  hypothetical protein  49.83 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1420  hypothetical protein  50.51 
 
 		 297 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7314  hypothetical protein  48.8 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6572  hypothetical protein  48.8 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2010  hypothetical protein  48.8 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.963888  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1694  hypothetical protein  49.83 
 
 		 297 aa  279  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2601  hypothetical protein  48.45 
 
 		 294 aa  278  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4978  Beta tubulin, autoregulation binding site  51.22 
 
 		 291 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0917  hypothetical protein  50.53 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0272  phage protein  47.52 
 
 		 294 aa  254  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3712  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  47.16 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1070  phage protein  47.1 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5970  hypothetical protein  48.06 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.630927  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1351  hypothetical protein  43.97 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1142  hypothetical protein  46.18 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147655  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1087  hypothetical protein  45.42 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0412528  normal  0.0298514 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2477  hypothetical protein  45.67 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883533  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2165  hypothetical protein  41.61 
 
 		 296 aa  235  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1644  phage protein  43.31 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0599  hypothetical protein  41.49 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2889  phage protein  44.91 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0194233  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1991  phage protein  38.95 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000642219  normal  0.0137589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2487  hypothetical protein  34.49 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0748  hypothetical protein  32.48 
 
 		 268 aa  149  8e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.199335  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0254  hypothetical protein  27.64 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.121128  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0835  hypothetical protein  26.43 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.794206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3130  phage protein  34.83 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71387  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0931  hypothetical protein  47.65 
 
 		 222 aa  135  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.258225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3903  hypothetical protein  47.24 
 
 		 216 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.627061  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7156  hypothetical protein  37.02 
 
 		 362 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4082  hypothetical protein  33.44 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.086292  normal  0.0251599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1645  hypothetical protein  33.55 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2726  hypothetical protein  28.37 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000479777  normal  0.0230175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3056  hypothetical protein  26.69 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0286  hypothetical protein  24.44 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1314  putative phage associated protein  28.78 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1080  hypothetical protein  23.68 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>