More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1044 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0951  para-aminobenzoate synthase, component I  83.07 
 
 
705 aa  1193    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.754558  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  50.5 
 
 
686 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1044  para-aminobenzoate synthase, component I  100 
 
 
704 aa  1441    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.869303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3468  anthranilate synthase, component II  46.38 
 
 
714 aa  619  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  45.85 
 
 
731 aa  619  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.03 
 
 
732 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4583  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.22 
 
 
732 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1666  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.77 
 
 
700 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1366  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.78 
 
 
762 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0518359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3761  para-aminobenzoate synthase  45.31 
 
 
703 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331515  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1766  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.88 
 
 
718 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2111  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.92 
 
 
687 aa  522  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0378177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5650  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.26 
 
 
672 aa  495  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3391  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.18 
 
 
637 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42151  predicted protein  37.17 
 
 
760 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.062393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.19 
 
 
721 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1828  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.96 
 
 
518 aa  300  5e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.88 
 
 
719 aa  279  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05730  4-amino-4-deoxychorismate synthase, putative  30.9 
 
 
809 aa  278  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.33 
 
 
466 aa  276  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  38 
 
 
682 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.37 
 
 
474 aa  261  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  37.88 
 
 
495 aa  260  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  38.23 
 
 
468 aa  257  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06300  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.92 
 
 
527 aa  256  7e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0721872  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74393  para-aminobenzoate synthase, (PABA)  27.76 
 
 
769 aa  253  8.000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0953381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.15 
 
 
460 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.31 
 
 
461 aa  242  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.5 
 
 
458 aa  240  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06550  para aminobenzoic acid synthetase (Eurofung)  28.25 
 
 
823 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0798538  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  35.44 
 
 
471 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  35.62 
 
 
462 aa  232  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.62 
 
 
480 aa  232  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2120  anthranilate synthase component I  32.53 
 
 
503 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.016796 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  33.18 
 
 
448 aa  231  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  33.18 
 
 
448 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35 
 
 
467 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  35.1 
 
 
458 aa  228  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  32.42 
 
 
517 aa  227  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  32.22 
 
 
514 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.31 
 
 
467 aa  226  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  36.91 
 
 
497 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.4 
 
 
482 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4527  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  36.6 
 
 
437 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  33.12 
 
 
491 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  39.02 
 
 
408 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  32.27 
 
 
491 aa  225  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.91 
 
 
434 aa  224  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.4 
 
 
470 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  33.96 
 
 
467 aa  224  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  32.72 
 
 
491 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.98 
 
 
470 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0342  anthranilate synthase component I  35.03 
 
 
469 aa  222  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0367738  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  39.02 
 
 
453 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.6 
 
 
493 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  37.79 
 
 
443 aa  221  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.01 
 
 
444 aa  221  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2471  anthranilate synthase, component I  31.48 
 
 
494 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.86 
 
 
466 aa  221  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  36.73 
 
 
467 aa  221  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.36 
 
 
457 aa  220  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.26 
 
 
470 aa  220  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  34.37 
 
 
471 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3481  anthranilate synthase component I  30.79 
 
 
491 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.05 
 
 
466 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  33.63 
 
 
458 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.94 
 
 
480 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  33.63 
 
 
458 aa  219  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1255  anthranilate synthase component I  35.34 
 
 
500 aa  219  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3722  anthranilate synthase component I  32.7 
 
 
491 aa  219  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.803971 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.16 
 
 
470 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  36.7 
 
 
430 aa  218  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.73 
 
 
456 aa  218  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.41 
 
 
458 aa  218  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.57 
 
 
465 aa  217  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  32.71 
 
 
491 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.05 
 
 
472 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  32.43 
 
 
491 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04195  anthranilate synthase component I  32.47 
 
 
491 aa  217  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.27 
 
 
466 aa  216  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2228  anthranilate synthase, component I  30.8 
 
 
521 aa  216  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.7 
 
 
490 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0157  anthranilate synthase component I  31.62 
 
 
501 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.56 
 
 
473 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  31.89 
 
 
495 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.44 
 
 
466 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  32.44 
 
 
489 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  34.96 
 
 
456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  32.57 
 
 
491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2362  anthranilate synthase component I  32.33 
 
 
495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2036  Anthranilate synthase  44.53 
 
 
478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0992508  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2940  anthranilate synthase component I  31.6 
 
 
471 aa  215  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.256099 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  36.44 
 
 
430 aa  214  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2369  anthranilate synthase component I  32.1 
 
 
493 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4701  para-aminobenzoate synthase component I  34.27 
 
 
503 aa  214  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  31.04 
 
 
485 aa  214  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  32.7 
 
 
491 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0179  anthranilate synthase component I  31.26 
 
 
501 aa  214  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2877  anthranilate synthase component I  32.22 
 
 
489 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0926  anthranilate synthase component I  31.89 
 
 
490 aa  213  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>