30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1027 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1027  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  796    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5530  hypothetical protein  24.66 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1182  hypothetical protein  24.28 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.331396  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0667  hypothetical protein  21.92 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0869947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1485  hypothetical protein  22.12 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.807311  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4332  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0136  hypothetical protein  26.92 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1036  hypothetical protein  24.29 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  23.08 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  23.08 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  23.36 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  28.28 
 
 		 375 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  20.94 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  28.28 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  26.75 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01201  hypothetical protein  27.89 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.640897  normal  0.481871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  23.55 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  25.18 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  22.49 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  28.97 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3564  protein of unknown function DUF482  23.93 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.221346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  29.57 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  27.45 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  24.02 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1575  protein of unknown function DUF482  21.03 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.365702 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1187  hypothetical protein  24.83 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  29.05 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  29.05 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  23.33 
 
 		 409 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  25.68 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.483949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>