22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0838 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0838  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  227  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.011638  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0798  hypothetical protein  78.45 
 
 		 117 aa  148  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.249703  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2070  hypothetical protein  44.04 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.981444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2334  hypothetical protein  43 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.777792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3213  hypothetical protein  47.31 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.052023 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2656  hypothetical protein  41.05 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1147  hypothetical protein  54.84 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3212  hypothetical protein  51.39 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2943  hypothetical protein  46.15 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03903  hypothetical protein  43.59 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0850  hypothetical protein  51.61 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272158  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1320  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2581  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2751  hypothetical protein  38.57 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1451  hypothetical protein  46.88 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2529  hypothetical protein  43.1 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1252  hypothetical protein  35.21 
 
 		 225 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2902  hypothetical protein  35.21 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0615892  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  39.34 
 
 		 224 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2823  hypothetical protein  39.34 
 
 		 232 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0174  hypothetical protein  35.48 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1524  hypothetical protein  38.98 
 
 		 173 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>