41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4726 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4726  protein of unknown function DUF1205  100 
 
 
418 aa  830    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4727  protein of unknown function DUF1205  40.98 
 
 
416 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  38.73 
 
 
424 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4715  protein of unknown function DUF1205  40.49 
 
 
419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4707  protein of unknown function DUF1205  39.11 
 
 
428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  40.84 
 
 
429 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4700  protein of unknown function DUF1205  40.1 
 
 
424 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.337723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4699  protein of unknown function DUF1205  37.64 
 
 
417 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.363631  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3487  protein of unknown function DUF1205  32.45 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4361  protein of unknown function DUF1205  33.18 
 
 
411 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000257109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2112  hypothetical protein  25.77 
 
 
467 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0819565  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4185  IroB  32.61 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2933  hypothetical protein  29.6 
 
 
472 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697027  normal  0.639426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  28.61 
 
 
380 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4360  glycosyl transferase family 28  30.71 
 
 
443 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000448703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2968  hypothetical protein  24.64 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3071  hypothetical protein  24.4 
 
 
371 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2949  glycosyltransferase  24.4 
 
 
371 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.63295e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2915  IroB  24.4 
 
 
371 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2885  IroB  24.4 
 
 
371 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  26.63 
 
 
378 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1369  glycosyl transferase  24.08 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1263  hypothetical protein  24.33 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  26.3 
 
 
383 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  20.57 
 
 
397 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4978  glycosyltransferase, MGT family  27.21 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  23.82 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4977  glycosyltransferase, MGT family  27.45 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  23.31 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  34.48 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2896  glycosyltransferase, MGT family  23.41 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  21.69 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  32.46 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4150  hypothetical protein  27.46 
 
 
223 aa  47  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  28.97 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  21.93 
 
 
399 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1778  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.72129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1765  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6314  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
419 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>