33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2617 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2617  metallophosphoesterase  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0457152  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1088  metallophosphoesterase  66.91 
 
 
324 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3411  metallophosphoesterase  65.66 
 
 
292 aa  355  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.964336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0497  metallophosphoesterase  66.03 
 
 
279 aa  353  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2235  metallophosphoesterase  65.22 
 
 
292 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336195  normal  0.178546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1505  metallophosphoesterase  64.68 
 
 
291 aa  348  5e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2094  metallophosphoesterase  65.22 
 
 
293 aa  348  8e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443095  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5285  metallophosphoesterase  67.05 
 
 
281 aa  345  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3806  Ser/Thr protein phosphatase family protein  66.67 
 
 
279 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0262444  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1725  metallophosphoesterase  59.26 
 
 
328 aa  308  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22230  predicted phosphohydrolase  59.34 
 
 
276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484241  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12808  hypothetical protein  56.98 
 
 
324 aa  306  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000280695  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2093  metallophosphoesterase  55.39 
 
 
320 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2076  metallophosphoesterase  55.39 
 
 
320 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0272724  normal  0.436054 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2139  metallophosphoesterase  55.39 
 
 
320 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0227605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4030  metallophosphoesterase  56 
 
 
315 aa  299  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2327  metallophosphoesterase  56.4 
 
 
315 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0203181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2156  metallophosphoesterase  56.83 
 
 
321 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0170  metallophosphoesterase  51.53 
 
 
289 aa  254  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.76404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2453  hypothetical protein  26.22 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1678  serine/threonine protein phosphatase family protein  30.19 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.854416  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33447  predicted protein  28.67 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47431  predicted protein  29.41 
 
 
412 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28127  predicted protein  24.5 
 
 
338 aa  52.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.16842  normal  0.161123 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2016  hypothetical protein  21.58 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2512  hypothetical protein  23.1 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2463  hypothetical protein  23.1 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00247056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  25.62 
 
 
258 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0687  metallophosphoesterase  21.43 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  36.23 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  36.23 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1105  hypothetical protein  32.04 
 
 
279 aa  42.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000289527  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1429  hypothetical protein  21.14 
 
 
575 aa  42.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00343203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>