18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2511 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2511  Citrate transporter  100 
 
 		 447 aa  842    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3386  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  70.43 
 
 		 423 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287766  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0160  hypothetical protein  32.37 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0419  citrate transporter  31.12 
 
 		 431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0573  Citrate transporter  25.36 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0653  citrate transporter  24.32 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3767  citrate transporter  25.39 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0424622  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0129  H+/gluconate symporter  23.54 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1670  H+/gluconate symporter or related permease  20 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0507007  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0501  H+/gluconate symporter related permease  22.06 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  27.17 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1711  citrate transporter  31.03 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  28.03 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  25.74 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  25.74 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  25.74 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  25.74 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  26.33 
 
 		 432 aa  43.1  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>