10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0160 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0160  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  845    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0419  citrate transporter  42.56 
 
 		 431 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2511  Citrate transporter  32.59 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3386  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  32.49 
 
 		 423 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287766  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0653  citrate transporter  30.89 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0573  Citrate transporter  28.75 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3767  citrate transporter  28.82 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0424622  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0129  H+/gluconate symporter  24.7 
 
 		 430 aa  130  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0501  H+/gluconate symporter related permease  24.31 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1670  H+/gluconate symporter or related permease  23.83 
 
 		 429 aa  89.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0507007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>