33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0165 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0165  Clp domain protein  100 
 
 		 312 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2787  Clp domain protein  38.54 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25210  polyketide cyclase / dehydrase family protein  31.13 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0765  Clp domain protein  28.78 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  26.98 
 
 		 814 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  24.66 
 
 		 858 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  24.66 
 
 		 835 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  25.11 
 
 		 852 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2678  ATPase  26.22 
 
 		 840 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  24.66 
 
 		 830 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  24.2 
 
 		 834 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  24.2 
 
 		 851 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  25.44 
 
 		 824 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  24.66 
 
 		 841 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  28.4 
 
 		 825 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  24.66 
 
 		 839 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  30.6 
 
 		 839 aa  43.9  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.1897600000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  22.83 
 
 		 846 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  30.26 
 
 		 822 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  30.26 
 
 		 822 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  24.09 
 
 		 840 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  23.74 
 
 		 858 aa  43.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  24.2 
 
 		 836 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  26.94 
 
 		 828 aa  42.7  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  24.2 
 
 		 844 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  24.2 
 
 		 844 aa  42.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  30.26 
 
 		 825 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  30.26 
 
 		 823 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  30.26 
 
 		 825 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  30.26 
 
 		 821 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  30.26 
 
 		 824 aa  42.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  29.61 
 
 		 855 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  29.61 
 
 		 855 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>