20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_R0037 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292769  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0026  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0023  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0022  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0023  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320575  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0037  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0042  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140875  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0045  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0021  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.627845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26000  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14020  tRNA-Leu  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1377  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0019  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000251522  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07920  tRNA-Leu  82.89 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0780487  normal  0.280122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0050  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.858981  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0040  tRNA-Leu  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0046  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.745536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>