22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4228 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4228  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 2395 aa  4685    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.687969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4109  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.08 
 
 		 775 aa  84.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.593331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.38 
 
 		 2724 aa  76.3  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0767  conserved repeat domain protein  25.46 
 
 		 2568 aa  71.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0045  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  41.78 
 
 		 1468 aa  62.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.292772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0148  conserved repeat domain protein  35 
 
 		 2553 aa  58.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  30.06 
 
 		 2713 aa  56.2  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  29.4 
 
 		 1946 aa  54.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  32.58 
 
 		 3911 aa  54.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24760  conserved repeat protein  37.74 
 
 		 1516 aa  54.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.216781 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  36.94 
 
 		 807 aa  53.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  30.6 
 
 		 2489 aa  48.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3600  hypothetical protein  29.03 
 
 		 245 aa  48.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  34.53 
 
 		 2000 aa  48.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  29.32 
 
 		 2886 aa  48.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  35.51 
 
 		 1984 aa  47.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36570  conserved repeat protein  28.33 
 
 		 1923 aa  48.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0546  hypothetical protein  27.66 
 
 		 571 aa  47.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  31.97 
 
 		 2490 aa  47.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  25.56 
 
 		 3394 aa  46.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  30.41 
 
 		 2358 aa  45.8  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  30.41 
 
 		 2358 aa  45.8  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>