31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3705 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3705    100 
 
 		 938 bp  1859    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00230013  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2523  Integrase catalytic region  99.47 
 
 		 939 bp  1814    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011837  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2446  Integrase catalytic region  92.23 
 
 		 939 bp  1275    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000102431  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1224  Integrase catalytic region  93.5 
 
 		 939 bp  1370    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.401317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1220  Integrase catalytic region  93.5 
 
 		 939 bp  1370    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1219    93.5 
 
 		 2912 bp  1370    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.592075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3301  Integrase catalytic region  93.33 
 
 		 939 bp  87.7  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2895  Integrase catalytic region  93.33 
 
 		 939 bp  87.7  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3430  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 930 bp  79.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2811  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 930 bp  79.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.675485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4732  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 930 bp  79.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4701  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 930 bp  79.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4663  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 930 bp  79.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2615  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 930 bp  79.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3614  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 930 bp  79.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0711    88.89 
 
 		 3753 bp  79.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2167    88.89 
 
 		 2989 bp  79.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2169  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 930 bp  79.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0954  hypothetical protein  86.59 
 
 		 414 bp  75.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119757  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0936  hypothetical protein  86.59 
 
 		 321 bp  75.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0503    93.62 
 
 		 256 bp  69.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00200956  normal  0.0242434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0599    85.9 
 
 		 520 bp  67.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  96.43 
 
 		 906 bp  48.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  96.43 
 
 		 906 bp  48.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    96.43 
 
 		 2015 bp  48.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3726  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaI subunit  96.43 
 
 		 762 bp  48.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.790038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    96.43 
 
 		 802 bp  48.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4707  hypothetical protein  96.43 
 
 		 309 bp  48.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  96.43 
 
 		 915 bp  48.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  96.43 
 
 		 906 bp  48.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  96.43 
 
 		 906 bp  48.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>