12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0599 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0599    100 
 
 		 520 bp  1031    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  88.24 
 
 		 867 bp  71.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2523  Integrase catalytic region  85.9 
 
 		 939 bp  67.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011837  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3705    85.9 
 
 		 938 bp  67.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00230013  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0954  hypothetical protein  94.74 
 
 		 414 bp  60  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119757  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2446  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 939 bp  56  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000102431  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1219    84 
 
 		 2912 bp  54  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.592075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1220  Integrase catalytic region  84 
 
 		 939 bp  54  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1224  Integrase catalytic region  84 
 
 		 939 bp  54  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.401317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2895  Integrase catalytic region  87.04 
 
 		 939 bp  52  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3301  Integrase catalytic region  87.04 
 
 		 939 bp  52  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0936  hypothetical protein  88.64 
 
 		 321 bp  48.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>