12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3464 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3464  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000205348  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1025  hypothetical protein  36.71 
 
 		 324 aa  86.3  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.995963  decreased coverage  0.00250254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2140  hypothetical protein  44.72 
 
 		 273 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12440  hypothetical protein  39.52 
 
 		 438 aa  80.5  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.192453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  34.25 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3143  hypothetical protein  35.48 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6583  hypothetical protein  35.9 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.260944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0151  lipoprotein, putative  36.15 
 
 		 424 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5541  hypothetical protein  37.12 
 
 		 461 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161942 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4283  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 		 600 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.916194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3294  hypothetical protein  30.91 
 
 		 633 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0627  hypothetical protein  46.55 
 
 		 227 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>