22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1269 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1269  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  909    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0914584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2575  hypothetical protein  29.84 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6505  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  35.67 
 
 		 621 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1086  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3306  hypothetical protein  28.71 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4218  hypothetical protein  31.35 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.341342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1162  hypothetical protein  36.13 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000484736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4858  hypothetical protein  29.6 
 
 		 506 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127586  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1365  hypothetical protein  29.39 
 
 		 508 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.113149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0063  hypothetical protein  30.61 
 
 		 595 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1873  hypothetical protein  34.55 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04950  hypothetical protein  33.01 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10973  integral membrane protein  30.77 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0198521  normal  0.799672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0654  hypothetical protein  36 
 
 		 495 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7983  hypothetical protein  30.08 
 
 		 530 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28140  hypothetical protein  34.01 
 
 		 539 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2535  PE-PGRS family protein  35.88 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.289431 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  28.05 
 
 		 3242 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4200  hypothetical protein  37.04 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0938646  hitchhiker  0.00891245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3810  hypothetical protein  33.54 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0736  PE-PGRS family protein  33.33 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3997  hypothetical protein  35.29 
 
 		 421 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0332609  normal  0.158785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>