30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0710 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0710  OsmC family protein  100 
 
 
154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0784  OsmC family protein  43.62 
 
 
154 aa  114  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30670  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  45.74 
 
 
171 aa  110  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12938  hypothetical protein  41.22 
 
 
137 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0241589  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1570  OsmC family protein  40.94 
 
 
145 aa  100  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00295172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2074  OsmC family protein  40.94 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2173  OsmC family protein  38.58 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2839  OsmC family protein  37.67 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4190  OsmC family protein  40.16 
 
 
163 aa  94  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.708913  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1983  OsmC family protein  38.66 
 
 
146 aa  94  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1951  OsmC-like protein  38.58 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1997  OsmC family protein  38.58 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.608934  normal  0.376979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1931  OsmC family protein  38.58 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110591  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2855  OsmC family protein  40.17 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8006  OsmC family protein  34.85 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16800  OsmC-like protein  38.02 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0440531  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1788  hypothetical protein  31.06 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20740  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.92 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104919  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2692  OsmC family protein  32.68 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0751564  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2694  OsmC family protein  36.92 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448513  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0403  OsmC-like protein  29.1 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7915  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  33.33 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1018  OsmC family protein  38.17 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.84 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136594  normal  0.328629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2637  OsmC family protein  26.05 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  22.54 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0153  OsmC family protein  27.78 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.818803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2833  OsmC family protein  26.32 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  29.86 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0432  OsmC-like protein  27.5 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>