29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0528 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0528  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  214  2e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0170  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  34.09 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3032  NADH dehydrogenase  37.5 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219473  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2293  NADH dehydrogenase  36.73 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03960  conserved hypothetical protein  33.93 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4231  NADH dehydrogenase  41.27 
 
 
136 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794715  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1106  hypothetical protein  32.58 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.247743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0296  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  35.9 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.511676  decreased coverage  0.000705293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2418  NADH dehydrogenase  39.68 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.211184  normal  0.0219307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1809  NADH dehydrogenase  42.86 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1267  NADH dehydrogenase  34.29 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6039  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  33.77 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0258957  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3297  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  34.67 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223243  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02260  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B17.2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06540)  32.32 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.634001 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1760  NADH dehydrogenase  42.86 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00569729  normal  0.0708647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2555  NADH dehydrogenase  36.51 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.645895  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2699  NADH dehydrogenase  37.5 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0192711  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0184  NADH:ubiquinone oxidoreductase family protein  38.46 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1784  NADH dehydrogenase  37.88 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34392  predicted protein  40.32 
 
 
219 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736354  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1450  NADH dehydrogenase  33.85 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0948  NADH dehydrogenase  36.11 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.15048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1531  NADH dehydrogenase  36.11 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91354  normal  0.684838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1719  NADH dehydrogenase  43.4 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.89803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1726  NADH dehydrogenase  36.11 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0317452  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0186  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  32 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.339741 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0898  NADH dehydrogenase  41.38 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0902  NADH dehydrogenase  41.38 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2277  NADH dehydrogenase  39.66 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>