18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5133 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5133  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1620  hypothetical protein  82.48 
 
 		 234 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4556  hypothetical protein  74.79 
 
 		 234 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4644  hypothetical protein  74.79 
 
 		 234 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4939  hypothetical protein  74.79 
 
 		 234 aa  354  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10799  hypothetical protein  72.37 
 
 		 228 aa  328  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3616  hypothetical protein  58.93 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.689056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6882  deacetylase-like protein  40.99 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  29.91 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  30.12 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  26.69 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  29.81 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  30.25 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17920  hypothetical protein  30.19 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00986232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  29.52 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1009  putative deacetylase  30.06 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00774779  hitchhiker  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4433  hypothetical protein  27.71 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1223  hypothetical protein  27.49 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>