33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0399 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0399  ferredoxin reductase  100 
 
 		 71 aa  141  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  70.49 
 
 		 83 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  60 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  52.38 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  54.24 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  54.24 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  49.28 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  51.56 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  51.52 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1825  hypothetical protein  52.46 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0144614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  47.54 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  45.9 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  41.94 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  39.68 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  39.68 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  39.68 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  40.32 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  45.9 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  38.33 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  37.1 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  37.14 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  36.51 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  36.51 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  36.51 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  43.33 
 
 		 63 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  43.33 
 
 		 63 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  39.39 
 
 		 65 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  39.39 
 
 		 65 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  39.39 
 
 		 65 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  39.29 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  34.43 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  35.14 
 
 		 104 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  35.14 
 
 		 104 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>