29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0768 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0768  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  390  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0214  hypothetical protein  40.54 
 
 
198 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1607  hypothetical protein  37.31 
 
 
215 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.536381  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0685  protein of unknown function DUF447  41.76 
 
 
187 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1414  hypothetical protein  37.77 
 
 
185 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.378071  normal  0.11817 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0665  hypothetical protein  35.15 
 
 
202 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1727  hypothetical protein  37.7 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1107  hypothetical protein  37.02 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0765  protein of unknown function DUF447  32.97 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00979308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2337  protein of unknown function DUF447  31.55 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0425454  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0630  hypothetical protein  26.37 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1323  hypothetical protein  25.27 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1353  hypothetical protein  24.44 
 
 
181 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5940  hypothetical protein  29.73 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2584  protein of unknown function DUF447  28.72 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.735694  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2424  protein of unknown function DUF447  28.43 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0904426  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1332  hypothetical protein  25.54 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.424525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0035  protein of unknown function DUF447  28.42 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5322  protein of unknown function DUF447  29.79 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3074  protein of unknown function DUF447  26.44 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2455  hypothetical protein  30.37 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.11758  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1580  hypothetical protein  30.32 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000289305  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1890  protein of unknown function DUF447  26 
 
 
227 aa  48.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2617  hypothetical protein  28.09 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0409017  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0868  hypothetical protein  23.4 
 
 
190 aa  47  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4099  hypothetical protein  25.68 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6498  hypothetical protein  27.78 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760399  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5018  hypothetical protein  26.11 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1792  hypothetical protein  25.64 
 
 
198 aa  41.2  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>