19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0606 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0606  competence-like protein  100 
 
 		 140 aa  283  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.216559  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  52.33 
 
 		 421 aa  94.7  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0715  hypothetical protein  41.67 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.100612  normal  0.0883598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  48.28 
 
 		 479 aa  88.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3773  hypothetical protein  45.45 
 
 		 259 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  48.42 
 
 		 1931 aa  83.6  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 477 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4471  hypothetical protein  35.94 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  38.71 
 
 		 301 aa  80.9  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02760  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.62 
 
 		 420 aa  72.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7022  hypothetical protein  33.91 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2261  hypothetical protein  36.56 
 
 		 331 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000590527  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1905  hypothetical protein  43.21 
 
 		 333 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  39.33 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0008  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.38 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.203843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 		 451 aa  53.9  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2842  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.47 
 
 		 416 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0933431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.53 
 
 		 1051 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>