More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1818 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1818  elongation factor G  100 
 
 		 642 aa  1291    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0543  elongation factor G  55.32 
 
 		 660 aa  720    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2751  elongation factor G  56.99 
 
 		 661 aa  648    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2247  elongation factor G  46.18 
 
 		 669 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.040202  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0922  elongation factor G  45.72 
 
 		 667 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122297  normal  0.0871733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1140  elongation factor G  45.23 
 
 		 671 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2248  elongation factor G  45.8 
 
 		 670 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.456219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2978  elongation factor G  45.47 
 
 		 696 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.493994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3762  elongation factor G  43.57 
 
 		 681 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0675022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1300  elongation factor G  46.28 
 
 		 688 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1634  elongation factor G  44.24 
 
 		 675 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4806  elongation factor G  45.58 
 
 		 683 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1106  elongation factor G  45.02 
 
 		 699 aa  552  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4119  elongation factor G  45.88 
 
 		 682 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3921  elongation factor G  44.9 
 
 		 683 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2110  elongation factor G  44.84 
 
 		 671 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2771  elongation factor G  41.53 
 
 		 688 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252482  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1805  elongation factor G  45.83 
 
 		 655 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.504417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1336  elongation factor G  42.97 
 
 		 678 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1277  elongation factor G  45.19 
 
 		 686 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836232  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1365  elongation factor G  42.97 
 
 		 678 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0359186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5234  elongation factor G  43.22 
 
 		 678 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5941  elongation factor G  42.08 
 
 		 678 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3294  elongation factor G  43.01 
 
 		 680 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0279  small GTP-binding protein  41.88 
 
 		 676 aa  500  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2082  elongation factor G  41.87 
 
 		 662 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0399925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4086  elongation factor G  37.34 
 
 		 653 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5899  elongation factor G  36.46 
 
 		 653 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  32.94 
 
 		 693 aa  340  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  33.78 
 
 		 692 aa  340  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  34.12 
 
 		 691 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  33.04 
 
 		 692 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  32.44 
 
 		 695 aa  337  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  35.15 
 
 		 692 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  33.28 
 
 		 692 aa  333  6e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  33.68 
 
 		 697 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  33.92 
 
 		 692 aa  330  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.98 
 
 		 692 aa  330  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  33.53 
 
 		 692 aa  330  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  32.2 
 
 		 691 aa  330  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  32.49 
 
 		 692 aa  330  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  33.08 
 
 		 692 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.6 
 
 		 691 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  32.34 
 
 		 692 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  32.34 
 
 		 692 aa  328  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  32.34 
 
 		 692 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  32.34 
 
 		 692 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  32.34 
 
 		 692 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  32.34 
 
 		 692 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  32.34 
 
 		 692 aa  327  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  32.19 
 
 		 692 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  31.74 
 
 		 689 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  33.78 
 
 		 689 aa  325  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  32.7 
 
 		 691 aa  325  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  33.58 
 
 		 697 aa  323  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  31.01 
 
 		 694 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  33.33 
 
 		 685 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  33.92 
 
 		 692 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  32.9 
 
 		 704 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  32.45 
 
 		 692 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  35.36 
 
 		 696 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  31.7 
 
 		 695 aa  322  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  31.74 
 
 		 692 aa  321  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  34.83 
 
 		 683 aa  321  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  32.31 
 
 		 691 aa  321  3e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  30.97 
 
 		 693 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  31.74 
 
 		 692 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  32.46 
 
 		 688 aa  320  5e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  33.43 
 
 		 699 aa  320  5e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  33.43 
 
 		 699 aa  320  6e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  31.45 
 
 		 692 aa  320  7e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  31.46 
 
 		 692 aa  320  7e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  33.38 
 
 		 704 aa  319  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  31.63 
 
 		 698 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  35.3 
 
 		 695 aa  318  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  32.4 
 
 		 691 aa  318  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  33.33 
 
 		 680 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  31.92 
 
 		 698 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  32.89 
 
 		 692 aa  318  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  31.63 
 
 		 698 aa  317  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  31.63 
 
 		 698 aa  317  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  32.55 
 
 		 690 aa  317  5e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  32.84 
 
 		 689 aa  317  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  31.77 
 
 		 698 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  31.77 
 
 		 698 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  31.77 
 
 		 698 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  31.77 
 
 		 698 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  32.1 
 
 		 692 aa  316  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.7 
 
 		 703 aa  316  8e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  32.2 
 
 		 694 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  32.05 
 
 		 694 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  33.58 
 
 		 685 aa  315  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  31.39 
 
 		 692 aa  316  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  34.49 
 
 		 704 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  32.75 
 
 		 692 aa  315  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  31.18 
 
 		 690 aa  315  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  31.04 
 
 		 698 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  35.48 
 
 		 687 aa  314  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  34.72 
 
 		 683 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  31.19 
 
 		 698 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>