37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0016 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00032499  normal  0.0128172 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  82.76 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0014  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.147165  hitchhiker  0.000226333 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0029  tRNA-Glu  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 101 bp  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0019  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.661812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 108 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 109 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0043  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0043  tRNA-Met  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.571582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.5604 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0003  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 112 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0015  tRNA-OTHER  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.321152 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0014  tRNA-OTHER  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0006  tRNA-Gly  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0033  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0028  tRNA-His  100 
 
 		 103 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0717588  decreased coverage  0.00491532 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>