14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0999 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0999  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 114 aa  226  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0343888  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  61.95 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2681  DNA polymerase beta domain protein region  53.1 
 
 		 114 aa  124  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1689  DNA polymerase beta subunit  54.39 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000949041  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  46.73 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1435  DNA polymerase beta subunit  37.76 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000437505  decreased coverage  0.0000020199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1268  DNA polymerase beta subunit  40.38 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.834804 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  33.02 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  31.73 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  30.53 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0494  DNA polymerase beta subunit  37.31 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>