15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0899 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0899  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  243  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  37.29 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2777  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.293295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2206  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364897  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0894  PilT protein domain protein  32.26 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  34.02 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1017  hypothetical protein  36.26 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.504321  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  36.56 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0181  PilT protein domain protein  37.23 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  28.1 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1436  hypothetical protein  30.43 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0608758  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0338  hypothetical protein  29.66 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.4702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  32.2 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2629  hypothetical protein  65.52 
 
 		 59 aa  40  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  26.79 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>