20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0422 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0422  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2033  conserved hypothetical protein  44.17 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  55.88 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0373  SirA family protein  52.94 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0379  SirA family protein  50 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0833  conserved hypothetical protein  34.26 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0894  SirA family protein  38.24 
 
 		 89 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.65 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  36.71 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  31.88 
 
 		 77 aa  45.1  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  33.9 
 
 		 75 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  36.54 
 
 		 76 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  30.56 
 
 		 89 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  26.76 
 
 		 93 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  30 
 
 		 77 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  31.43 
 
 		 75 aa  42  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  36.84 
 
 		 73 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  30 
 
 		 80 aa  42  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  33.33 
 
 		 82 aa  41.6  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  38.78 
 
 		 83 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>