9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0349 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0349  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  470  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0908  conserved hypothetical protein  39.58 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000484468  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1969  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000398406  hitchhiker  0.000000000710377 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0220  ABC-2 type transport system, membrane protein  29.22 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0612371 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2151  ABC-2 type transport system, membrane protein  29.34 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.148287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1079  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0486058 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1211  ABC-2 type transporter  32.93 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0428455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1779  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.496998  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0173  ABC-2 type transporter  26.35 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00869778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>