19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0055 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0055  50S ribosomal protein L14e  100 
 
 		 96 aa  188  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1371  50S ribosomal protein L14  71.88 
 
 		 96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0462  50S ribosomal protein L14e  72.22 
 
 		 98 aa  136  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0053  50S ribosomal protein L14e  63.74 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0088  50S ribosomal protein L14e  59.34 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0158  ribosomal protein L14E  59.34 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.574976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0079  50S ribosomal protein L14e  57.95 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.149247 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1127  50S ribosomal protein L14e  57.14 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000887763 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1126  50S ribosomal protein L14e  57.32 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1648  50S ribosomal protein L14e  54.88 
 
 		 77 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.481236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1498  50S ribosomal protein L14e  54.88 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0980  50S ribosomal protein L14e  53.66 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0266  50S ribosomal protein L14e  53.66 
 
 		 77 aa  90.1  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25577  predicted protein  37.68 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01166  60S ribosomal protein L6 (AFU_orthologue; AFUA_1G11130)  34.29 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03060  structural constituent of ribosome, putative  33.33 
 
 		 235 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34146  predicted protein  35.48 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.465057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0217  hypothetical protein  29.11 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.934654 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36611  predicted protein  35.09 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.264026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>