14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2259 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2259  membrane protein  100 
 
 		 632 aa  1244    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.158397  hitchhiker  0.00085756 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0093  membrane protein-like protein  23.83 
 
 		 667 aa  87.8  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1844  membrane protein-like protein  22.14 
 
 		 598 aa  84.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.478995  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0361  hypothetical protein  22.06 
 
 		 607 aa  79  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12710  predicted membrane protein  22.6 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.942677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0721  membrane protein-like protein  23.3 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  23.47 
 
 		 649 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1023  membrane protein-like protein  21.54 
 
 		 660 aa  55.1  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0605  hypothetical protein  23.61 
 
 		 606 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2842  hypothetical protein  23.86 
 
 		 675 aa  47.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00272449  normal  0.0507641 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2464  hypothetical protein  23.36 
 
 		 608 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0119  hypothetical protein  24.32 
 
 		 567 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00804511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27530  predicted membrane protein  21.73 
 
 		 669 aa  45.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00352231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0789  hypothetical protein  28.42 
 
 		 616 aa  43.9  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.685976  normal  0.296699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>