18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0595 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0595    100 
 
 		 456 bp  904    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.582139  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0590    84.14 
 
 		 456 bp  329  4.0000000000000003e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.477181  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0599    83.37 
 
 		 456 bp  276  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0546461  normal  0.180658 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3519    85.31 
 
 		 264 bp  172  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0579    79.14 
 
 		 456 bp  145  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000820232  unclonable  0.00000279378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3623  magnesium chelatase, ChlI subunit  93.94 
 
 		 681 bp  50.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0952268  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  93.94 
 
 		 1665 bp  50.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3762    93.94 
 
 		 701 bp  50.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522344  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  93.75 
 
 		 1509 bp  48.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  96.43 
 
 		 1335 bp  48.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  91.67 
 
 		 1515 bp  48.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  93.75 
 
 		 1539 bp  48.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  93.55 
 
 		 1539 bp  46.1  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 		 939 bp  46.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  96.3 
 
 		 1497 bp  46.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2200  imidazole glycerol-phosphate dehydratase/histidinol phosphatase  100 
 
 		 1071 bp  46.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0671818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  96.3 
 
 		 1605 bp  46.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  96.3 
 
 		 1710 bp  46.1  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>