21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5545 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  100 
 
 
532 aa  1025    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  35.41 
 
 
501 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  40.96 
 
 
587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  41.88 
 
 
597 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  41.56 
 
 
597 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2312  hypothetical protein  41.78 
 
 
599 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  41.56 
 
 
597 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  30.59 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1487  hypothetical protein  33.09 
 
 
525 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  32.43 
 
 
535 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  38.51 
 
 
602 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7240  hypothetical protein  37.58 
 
 
588 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.510618  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1669  hypothetical protein  30.54 
 
 
535 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  28.57 
 
 
535 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  36.68 
 
 
587 aa  134  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  35.21 
 
 
623 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  30.36 
 
 
344 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  31.08 
 
 
355 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0044  flagellar hook-associated protein FlgL  29.47 
 
 
347 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3479  flagellar hook-associated protein FlgL  27.97 
 
 
358 aa  43.5  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.0673338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0769  flagellar hook-associated protein FlgL  29.75 
 
 
303 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>