18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4505 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4505  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  58.43 
 
 
163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  53.85 
 
 
185 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  54.44 
 
 
170 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  53.33 
 
 
181 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  47.25 
 
 
177 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  50.54 
 
 
164 aa  92  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  47.78 
 
 
161 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  50 
 
 
163 aa  87.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5693  hypothetical protein  61.02 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201068  normal  0.494471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  42.53 
 
 
170 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  42.53 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  42.53 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  40.45 
 
 
188 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  36.67 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  39.33 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  30.68 
 
 
159 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>