21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3541 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3541  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  338  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.795937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2037  regulatory protein RecX  60.99 
 
 		 200 aa  144  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0520  regulatory protein RecX  62.21 
 
 		 206 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2303  hypothetical protein  60.23 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100929  hitchhiker  0.00859816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2260  regulatory protein RecX  58.43 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.442098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0639  regulatory protein RecX  43.11 
 
 		 198 aa  104  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2578  hypothetical protein  58.97 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.458172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4526  recombination regulator RecX  28.73 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  36.72 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5814  recombination regulator RecX  32.77 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3064  hypothetical protein  39.55 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4261  recombination regulator RecX  26.52 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1418  hypothetical protein  32.61 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0822  hypothetical protein  30.51 
 
 		 222 aa  52  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  33.58 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  31.75 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  36.22 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  41.82 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  37.14 
 
 		 221 aa  41.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1166  regulatory protein RecX  26.14 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>