19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5354 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5354  putative photosynthetic complex assembly protein  100 
 
 		 227 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.457563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4809  putative photosynthetic complex assembly protein  80.85 
 
 		 234 aa  324  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5276  putative photosynthetic complex assembly protein  79.5 
 
 		 238 aa  315  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1841  putative photosynthetic complex assembly protein  61.26 
 
 		 216 aa  221  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0719719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1737  putative photosynthetic complex assembly protein  43.84 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0616  photosynthetic complex assembly protein  45.41 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17866  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3729  putative photosynthetic complex assembly protein  43.59 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00156993  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2035  photosynthetic complex assembly protein  41.3 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3974  photosynthetic complex assembly protein  44.1 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728012  normal  0.262812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1320  photosynthetic complex assembly protein  44.02 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562837  normal  0.156317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6410  hypothetical protein  45 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3725  putative photosynthetic complex assembly protein  55.62 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1630  hypothetical protein  40.83 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3541  putative photosynthetic complex assembly protein  39.34 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0154  photosynthetic complex assembly protein  34.8 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1935  hypothetical protein  38.57 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0292  hypothetical protein  37.72 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1003  hypothetical protein  35.56 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  29.07 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>