More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4846 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  95.5 
 
 
355 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  95.5 
 
 
355 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  100 
 
 
355 aa  704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  69.74 
 
 
352 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  54.7 
 
 
354 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  42.55 
 
 
327 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  43.34 
 
 
334 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  43.25 
 
 
338 aa  265  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  39.75 
 
 
349 aa  260  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  36.65 
 
 
327 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  36.02 
 
 
327 aa  225  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  41.84 
 
 
340 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  37.8 
 
 
344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  42.82 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  42.52 
 
 
365 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  42.52 
 
 
365 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  42.01 
 
 
347 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  42.12 
 
 
330 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  42.38 
 
 
340 aa  208  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  42.6 
 
 
396 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  38.17 
 
 
348 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  42.6 
 
 
347 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  42.6 
 
 
347 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  42.6 
 
 
347 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  42.6 
 
 
347 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  42.6 
 
 
347 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  42.6 
 
 
347 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  38.51 
 
 
332 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  38.51 
 
 
332 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  40.92 
 
 
355 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  37.57 
 
 
348 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  39.32 
 
 
328 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  37.22 
 
 
348 aa  203  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  41.46 
 
 
340 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  41.46 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  35.62 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  36.39 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  42.73 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  37.46 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  37.69 
 
 
338 aa  196  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  41.75 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0447  Asparaginase/glutaminase  37.75 
 
 
323 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  33.23 
 
 
327 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  38.37 
 
 
331 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  35.31 
 
 
324 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  35.62 
 
 
324 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  35.62 
 
 
324 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  35.94 
 
 
324 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  35.94 
 
 
324 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  35.67 
 
 
352 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  35.94 
 
 
324 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  35.67 
 
 
352 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  35.67 
 
 
352 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  35.67 
 
 
356 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  35.33 
 
 
347 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0782  asparaginase  34.7 
 
 
320 aa  186  7e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  35.15 
 
 
354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2187  asparaginase/glutaminase  36.25 
 
 
320 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560936  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  35.67 
 
 
338 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3794  L-asparaginase  34.48 
 
 
310 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538157  hitchhiker  0.000000163476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1590  L-asparaginase  34.83 
 
 
310 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36341e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1551  L-asparaginase  34.14 
 
 
310 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000310324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1297  asparaginase/glutaminase  37.86 
 
 
320 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1837  asparaginase/glutaminase  34.17 
 
 
321 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1980  asparaginase  40.3 
 
 
333 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  35.12 
 
 
348 aa  176  6e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  33.84 
 
 
349 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1009  L-asparaginase II  33.98 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0200439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1657  L-asparaginase  34.83 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000496167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0779  L-asparaginase  33.23 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  37.25 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  35.67 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.881329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  35.67 
 
 
348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  35.67 
 
 
348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  35.33 
 
 
348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0094  asparaginase/glutaminase  37.76 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.875352  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  34.85 
 
 
348 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  33.91 
 
 
347 aa  172  7.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  34.29 
 
 
346 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  35.33 
 
 
348 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  35.33 
 
 
348 aa  172  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  35.33 
 
 
348 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  35.33 
 
 
348 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  35.33 
 
 
348 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  34.29 
 
 
346 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1566  asparaginase/glutaminase  32.31 
 
 
322 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646872  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1535  asparaginase/glutaminase  32.31 
 
 
322 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1046  L-asparaginase  29.45 
 
 
322 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101218  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1178  asparaginase/glutaminase  35.09 
 
 
329 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228392  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  38.76 
 
 
339 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  32.88 
 
 
352 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1679  asparaginase family protein  34.41 
 
 
320 aa  169  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0304633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1946  asparaginase/glutaminase  36.39 
 
 
352 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0515464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  35 
 
 
348 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  35.81 
 
 
316 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4951  L-asparaginase, type II  36.81 
 
 
323 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  35 
 
 
348 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  35 
 
 
348 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  35 
 
 
348 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  35 
 
 
348 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0792755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>