35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2853 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  72.46 
 
 		 502 aa  678    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  74.42 
 
 		 528 aa  723    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  100 
 
 		 508 aa  1020    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  75.96 
 
 		 516 aa  742    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  84.68 
 
 		 509 aa  843    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  93.1 
 
 		 508 aa  927    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  72.24 
 
 		 534 aa  729    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  76.55 
 
 		 512 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  72.54 
 
 		 500 aa  674    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  72.26 
 
 		 502 aa  675    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  76.83 
 
 		 513 aa  738    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  75.05 
 
 		 540 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  75.64 
 
 		 535 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  73.17 
 
 		 521 aa  712    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  73.93 
 
 		 533 aa  729    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2979  chlorophyllide reductase subunit Y  75.88 
 
 		 468 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.927182  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  92.7 
 
 		 508 aa  920    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1609  chlorophyllide reductase subunit Y  73.38 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  39.08 
 
 		 422 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  37.14 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  36.71 
 
 		 412 aa  274  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  40.72 
 
 		 438 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  36.65 
 
 		 412 aa  268  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  36.74 
 
 		 412 aa  266  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  37.65 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  38.59 
 
 		 422 aa  263  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  35.33 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  34.62 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.37 
 
 		 468 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.72 
 
 		 465 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2373  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.83 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0789  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.98 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.32 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0817  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.98 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.93 
 
 		 416 aa  44.3  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>