40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2421 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  100 
 
 
141 aa  271  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  90.07 
 
 
139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  89.36 
 
 
139 aa  170  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  67.48 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  45.65 
 
 
128 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  63.64 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  59.68 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  38.24 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  37.93 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  46.48 
 
 
196 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  45.78 
 
 
235 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  84.62 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  62.5 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  46.97 
 
 
201 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  62.5 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1569  hypothetical protein  59.52 
 
 
211 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3811  hypothetical protein  81.48 
 
 
124 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0228634  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  46.25 
 
 
209 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  58.33 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  45.83 
 
 
223 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0685  hypothetical protein  73.08 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  38.38 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0534  hypothetical protein  52.17 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  59.09 
 
 
230 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  33.95 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0984  hypothetical protein  41.27 
 
 
152 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  56.25 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3404  hypothetical protein  48.57 
 
 
244 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3358  BA14K family protein  47.83 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3533  BA14K family protein  48.57 
 
 
269 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100217  normal  0.403993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  31.62 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  54.84 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3209  hypothetical protein  48.57 
 
 
256 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1649  hypothetical protein  32.5 
 
 
150 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.989787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  56.67 
 
 
210 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1516  hypothetical protein  32.26 
 
 
169 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1466  hypothetical protein  31.91 
 
 
170 aa  41.2  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3014  hypothetical protein  48.39 
 
 
133 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12196  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0598  BA14K family protein  37.66 
 
 
159 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141665  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0550  BA14K family protein  38.71 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>