12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0345 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0345  zinc metalloproteinase Mpr protein  100 
 
 		 306 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.22412  normal  0.306363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2747  zinc metalloproteinase Mpr protein  40.48 
 
 		 268 aa  221  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3892  zinc metalloproteinase Mpr protein  40.54 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.472555  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1969  zinc metalloproteinase Mpr protein  33.88 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0542  hypothetical protein  47.88 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6488  hypothetical protein  50.33 
 
 		 244 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6567  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7399  zinc metalloproteinase Mpr protein  43.95 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0238  hypothetical protein  41.92 
 
 		 264 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02022  zinc metalloproteinase Mpr protein  33.33 
 
 		 184 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02021  zinc metalloproteinase Mpr protein  39.58 
 
 		 59 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.462142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2626  protein of unknown function SprT  25.89 
 
 		 189 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.52684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>