20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2435 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2435  prenyltransferase  100 
 
 
283 aa  564  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1981  prenyltransferase  62.9 
 
 
283 aa  371  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.650334  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1926  prenyltransferase  44.16 
 
 
307 aa  209  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.556074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1225  prenyltransferase  38.71 
 
 
307 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1715  prenyltransferase  29.85 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0256  prenyltransferase  27.86 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.837385  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0738  UbiA prenyltransferase  29.84 
 
 
304 aa  59.3  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2064  UbiA prenyltransferase  29.61 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1505  UbiA prenyltransferase  22.43 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.92 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  24.04 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.52 
 
 
376 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.61 
 
 
333 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1440  UbiA prenyltransferase  25.13 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.71 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.49 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0383  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  25.49 
 
 
577 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0340  prenyltransferase  23.86 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.08 
 
 
299 aa  42.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.11 
 
 
330 aa  42  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>