27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1224 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  30.09 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 319 aa  93.2  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  28.03 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  25.94 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  24.82 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  23.65 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.43 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  25.69 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  24.29 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  24.1 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  26.91 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  28.91 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  25.79 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  24.29 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  25.82 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  22.22 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  25.91 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  23.55 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  22.02 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  20.5 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  21.28 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  21.49 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  23.59 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  26.14 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>