201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0479 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0479  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 337 aa  692    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2400  phosphate uptake regulator, PhoU  56.97 
 
 		 344 aa  411  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.282043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1425  phosphate uptake regulator, PhoU  49.55 
 
 		 335 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1119  hypothetical protein  50.45 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0897  phosphate uptake regulator, PhoU  47.56 
 
 		 331 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.247428  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  31.36 
 
 		 348 aa  169  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1765  hypothetical protein  32.53 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3440  phosphate uptake regulator, PhoU  30.12 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1682  phosphate uptake regulator, PhoU  29.94 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0620  phosphate uptake regulator, PhoU  33.04 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3128  hypothetical protein  31.6 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2356  phosphate uptake regulator, PhoU  30.54 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1794  phosphate uptake regulator, PhoU  29 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0479748 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2476  phosphate uptake regulator, PhoU  29.79 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1545  phosphate uptake regulator, PhoU  28.4 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0914  phosphate uptake regulator, PhoU  29.08 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1968  phosphate uptake regulator, PhoU  29.12 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2950  putative regulatory protein  33.97 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11037  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0495  phosphate uptake regulator, PhoU  29.13 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1069  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0447  phosphate uptake regulator, PhoU  25.35 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000672536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0944  phosphate uptake regulator, PhoU  25.82 
 
 		 337 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1393  phosphate uptake regulator, PhoU  29.61 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1926  phosphate uptake regulator, PhoU  25.45 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0860  phosphate uptake regulator, PhoU  24.11 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.198015 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0595  phosphate uptake regulator, PhoU  25.3 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2363  phosphate uptake regulator, PhoU  28.89 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.486275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1065  phosphate uptake regulator, PhoU  29.87 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0353  phosphate uptake regulator, PhoU  24.56 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0896452  normal  0.250975 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1622  SpoVT/AbrB domain-containing protein  21.56 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00903094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0693  phosphate uptake regulator, PhoU  26.41 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2335  phosphate uptake regulator, PhoU  24.48 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  25.55 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0358933 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1386  phosphate uptake regulator, PhoU  24.14 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0312  phosphate uptake regulator, PhoU  24.71 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1659  SpoVT/AbrB domain-containing protein  30.89 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.724868  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1329  phosphate uptake regulator, PhoU  23.28 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.445187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1597  SpoVT/AbrB domain protein  24.23 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.755665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  31.03 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2081  phosphate uptake regulator, PhoU  24.71 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0893566 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2336  phosphate uptake regulator, PhoU  24.01 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.119502  normal  0.953358 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1904  SpoVT/AbrB domain protein  25.13 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  28.79 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  28.26 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  28.29 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  28.23 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1015  phosphate uptake regulator, PhoU  23.5 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.313422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  27.75 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.75 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  29.47 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1883  hypothetical protein  24.78 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.85602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  28.29 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1287  phosphate uptake regulator, PhoU  25.84 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1600  phosphate uptake regulator, PhoU  26.2 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  24.52 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  26.74 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  26.79 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  24.48 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1831  phosphate uptake regulator, PhoU  25.1 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000208314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  24.74 
 
 		 229 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  25.81 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  27.78 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  27.78 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  26.2 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  26.26 
 
 		 235 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  31.71 
 
 		 235 aa  53.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 228 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  26.8 
 
 		 239 aa  52.8  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  28.21 
 
 		 234 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  24.88 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  24.88 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  27.98 
 
 		 233 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  26.84 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  28.42 
 
 		 234 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  25.67 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  24.88 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.79 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  26.32 
 
 		 238 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  25.13 
 
 		 228 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.78 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  23.28 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.78 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  26.6 
 
 		 230 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.78 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.78 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.78 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.78 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.78 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  28.11 
 
 		 242 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  27.69 
 
 		 234 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  27.72 
 
 		 234 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  27.69 
 
 		 234 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>