20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8749 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8749  putative dienelactone hydrolase  100 
 
 
260 aa  520  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0693  dienelactone hydrolase  51.16 
 
 
260 aa  262  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560412  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1254  dienelactone hydrolase  49.05 
 
 
277 aa  231  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.546126  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3206  dienelactone hydrolase  44.36 
 
 
285 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4646  hypothetical protein  43.53 
 
 
265 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.177547  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2785  hypothetical protein  42.86 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.640406  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2009  dienelactone hydrolase family protein  43.02 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0037  dienelactone hydrolase  45.59 
 
 
262 aa  195  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.889494  normal  0.444574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4350  hypothetical protein  42.21 
 
 
277 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4119  hypothetical protein  42.21 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0781409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4194  hypothetical protein  42.21 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668259  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2068  dienelactone hydrolase  41.86 
 
 
283 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1154  dienelactone hydrolase family protein  43.19 
 
 
261 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0699822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07760  dienelactone hydrolase-like enzyme  28.48 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  27.68 
 
 
241 aa  46.2  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  28.32 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 
296 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  28.76 
 
 
249 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  28.07 
 
 
296 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>