13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6975 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6975  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  691    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2640  hypothetical protein  76.32 
 
 		 334 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6283  hypothetical protein  76.45 
 
 		 345 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3586  hypothetical protein  65.89 
 
 		 303 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1187  hypothetical protein  49.74 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0981  hypothetical protein  40.66 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0521584  hitchhiker  0.0000295872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1045  gifsy-2 prophage RecT  30.77 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  hitchhiker  0.00000406128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2843  gifsy-1 prophage protein  30.77 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2290  gifsy-1 prophage protein  30.77 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2820  RecT protein  32.34 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0195125  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4106  hypothetical protein  58.33 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.894986  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1725  hypothetical protein  25.11 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2380  hypothetical protein  25.53 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>