24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6636 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6636  DoxX family protein  100 
 
 
133 aa  253  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1676  DoxX family protein  80.92 
 
 
159 aa  189  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1995  DoxX family protein  80.92 
 
 
132 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1368  DoxX family protein  66.92 
 
 
133 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5238  DoxX family protein  55.24 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  43.85 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0759  hypothetical protein  50.48 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  39.68 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1036  hypothetical protein  35.25 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.049642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0969  hypothetical protein  35.25 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00033255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1114  hypothetical protein  35.25 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000313145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  36.75 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0957  hypothetical protein  34.43 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0947  hypothetical protein  37.74 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1288  hypothetical protein  42.2 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2972  DoxX  33.94 
 
 
118 aa  58.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3794  DoxX family protein  34.86 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1536  DoxX family protein  31.58 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2965  DoxX family protein  32.56 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.619526  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2840  DoxX family protein  33.72 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.78711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2822  DoxX family protein  33.72 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2850  DoxX  33.7 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5894  DoxX family protein  38.16 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3998  hypothetical protein  25 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>