More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5941 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1805  elongation factor G  58.22 
 
 		 655 aa  748    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.504417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5941  elongation factor G  100 
 
 		 678 aa  1328    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2978  elongation factor G  57.55 
 
 		 696 aa  761    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.493994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5234  elongation factor G  90.86 
 
 		 678 aa  1218    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1300  elongation factor G  58.77 
 
 		 688 aa  776    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4119  elongation factor G  58.47 
 
 		 682 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3921  elongation factor G  57.87 
 
 		 683 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1106  elongation factor G  57.86 
 
 		 699 aa  771    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2110  elongation factor G  54.64 
 
 		 671 aa  690    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4806  elongation factor G  57.72 
 
 		 683 aa  766    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1140  elongation factor G  47.26 
 
 		 671 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2248  elongation factor G  47.48 
 
 		 670 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.456219 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0922  elongation factor G  46.27 
 
 		 667 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122297  normal  0.0871733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2247  elongation factor G  46.13 
 
 		 669 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.040202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3762  elongation factor G  44.39 
 
 		 681 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0675022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1634  elongation factor G  45.73 
 
 		 675 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1277  elongation factor G  48.2 
 
 		 686 aa  551  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836232  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2771  elongation factor G  42.84 
 
 		 688 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252482  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1336  elongation factor G  43.71 
 
 		 678 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1365  elongation factor G  43.71 
 
 		 678 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0359186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3294  elongation factor G  44.91 
 
 		 680 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0279  small GTP-binding protein  43.9 
 
 		 676 aa  527  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1818  elongation factor G  41.78 
 
 		 642 aa  510  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0543  elongation factor G  43.27 
 
 		 660 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2751  elongation factor G  46.7 
 
 		 661 aa  488  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2082  elongation factor G  43.48 
 
 		 662 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0399925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5899  elongation factor G  36.66 
 
 		 653 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4086  elongation factor G  36.59 
 
 		 653 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  32.89 
 
 		 695 aa  350  5e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.37 
 
 		 692 aa  344  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  32.99 
 
 		 692 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  33.53 
 
 		 686 aa  336  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  31.49 
 
 		 692 aa  334  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  32.08 
 
 		 695 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  30.09 
 
 		 696 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  31.15 
 
 		 693 aa  331  3e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  31.31 
 
 		 698 aa  331  3e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  30.23 
 
 		 696 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  33.72 
 
 		 688 aa  328  3e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  30.58 
 
 		 689 aa  327  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  31.19 
 
 		 691 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  31.35 
 
 		 692 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  31.37 
 
 		 679 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  31.84 
 
 		 689 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  31.58 
 
 		 701 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  30.85 
 
 		 692 aa  324  3e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.65 
 
 		 682 aa  324  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  33.23 
 
 		 680 aa  323  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  30.61 
 
 		 692 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  30.69 
 
 		 682 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  29.15 
 
 		 688 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  31.54 
 
 		 691 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  30.19 
 
 		 694 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  32.84 
 
 		 690 aa  320  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  31.65 
 
 		 692 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  31.11 
 
 		 692 aa  320  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  28.93 
 
 		 682 aa  319  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  32.05 
 
 		 693 aa  318  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  30.91 
 
 		 690 aa  319  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  32.05 
 
 		 692 aa  318  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  29.91 
 
 		 696 aa  318  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  31.3 
 
 		 692 aa  318  3e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  30.33 
 
 		 692 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  30.32 
 
 		 692 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  32.37 
 
 		 691 aa  317  6e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  31.52 
 
 		 685 aa  316  8e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  32.99 
 
 		 697 aa  316  8e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  35.75 
 
 		 687 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  31.13 
 
 		 701 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  32.37 
 
 		 690 aa  316  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  30.59 
 
 		 697 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  30.77 
 
 		 670 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  32.64 
 
 		 673 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  32.2 
 
 		 689 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  31.31 
 
 		 689 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3451  elongation factor G  31.85 
 
 		 690 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  30.96 
 
 		 691 aa  314  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  31.37 
 
 		 692 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  31.27 
 
 		 691 aa  313  6.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  30.81 
 
 		 691 aa  313  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  30.71 
 
 		 697 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  30.98 
 
 		 692 aa  313  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  31.26 
 
 		 691 aa  312  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  32.15 
 
 		 701 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  31.52 
 
 		 700 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  31.47 
 
 		 704 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  33.48 
 
 		 708 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  30.96 
 
 		 692 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  30.71 
 
 		 693 aa  311  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768044  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  31.85 
 
 		 690 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0570  elongation factor G  30.71 
 
 		 693 aa  311  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  33.53 
 
 		 656 aa  310  4e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  30.81 
 
 		 692 aa  310  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  30.81 
 
 		 692 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  32.33 
 
 		 698 aa  310  8e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  32.81 
 
 		 719 aa  309  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.4 
 
 		 691 aa  309  9e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  30.78 
 
 		 703 aa  309  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  30.47 
 
 		 692 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  30.47 
 
 		 692 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>