16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3763 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3763  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  100 
 
 		 387 aa  771    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4980  hypothetical protein  47.58 
 
 		 685 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  47.47 
 
 		 709 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  44.07 
 
 		 556 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  40.22 
 
 		 470 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4983  hypothetical protein  49.28 
 
 		 549 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  38.46 
 
 		 787 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  38.46 
 
 		 787 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3988  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  38.54 
 
 		 601 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2637  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  27.67 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.79 
 
 		 714 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1150  proteinase  31.21 
 
 		 239 aa  47  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000104115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0699  hypothetical protein  28.12 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.759494 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  31.03 
 
 		 504 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  28.57 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  32.43 
 
 		 462 aa  43.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>